Организация научно-исследовательской работы в ВУЗе ориентирована на развитие основных научных направлений Филиала как базиса для повышения качества подготовки квалифицированных специалистов с высшим образованием, развитие международного сотрудничества в научной сфере, повышение качества образовательного процесса на основе привлечения студентов и слушателей к научно-исследовательской работе, внедрения элементов научной деятельности в учебный процесс, укрепления связи учебного процесса с научной работой Филиала.
Научно-исследовательская деятельность преподавателей ведется в соответствии с планами кафедр. Основными формами научной работы в филиале  являются выполнение как  фундаментальных, так и прикладных научно-исследовательских работ; разработка учебников, учебных пособий, монографий, написание диссертаций, статей, подготовка докладов, научных отчетов, сообщений, рецензий, заключений и других научно-методических материалов; выполнение научно-технических работ по разработке компьютерных учебников и учебных пособий; подготовка и проведение научных конференций, семинаров, совещаний, творческих дискуссий и обобщение их результатов.

Для активизации научной деятельности ППС и студентов, оценки ее результатов созданы научные школы:  Экономическая теория (080001) - (региональное представительство); Экономика труда (080007). Сложившиеся научные школы имеют значительный научный потенциал для решения актуальных проблем социально-экономического развития.
Особенно следует отметить научную школу Филиала в области экономики труда, возглавляемую директором Филиала проф. Абдурахмановым К.Х.
Кафедра «Экономическая теория» Филиала является региональным представительством научной школы «Экономическая теория» РЭУ им. Г.В. Плеханова, руководителем которой является заслуженный деятель науки РФ, д.э.н., проф. Журавлёва Г.П.
В 2010-2011 уч.г. в рамках деятельности научных школ подготовлено 2 монографии, 2 учебных пособия, 104 статьи, проведено 6 конференций, защищено 2 кандидатские диссертации.

В рамках научно-исследовательской работы преподаватели Филиала проводили исследования в соответствии со своими научными интересами по заданиям государственных научно-технических и фундаментальных программ исследований, грантам и инициативным тематикам.

Преподаватели Филиала в 2010/2011 уч.г. приняли участие в работе 49 международных и республиканских научно-практических конференций и семинаров, выступили на них с докладами, опубликовали тезисы и статьи в сборниках материалов конференций.
Результаты научно-исследовательской работы профессорско-преподавательского состава Филиала находят отражение в публикациях в научных журналах и сборниках, коллективных монографиях, докладах и выступлениях на различных международных и республиканских научных конференциях и семинарах. В 2010/2011 уч.г. ППС филиала было опубликовано и подготовлено к изданию 300 наименований научных и учебно-методических работ, из которых – 13 монографий (2), учебников (1) и учебных пособий (10) общим объемом 155,25 п.л.; 11 электронных учебников общим объемом 5214 Мб.; 1 сборник международной конференции общим объемом 27,2 п.л., 1 сборник студенческой научно-практической конференции общим объемом 16,75 п.л.; 1 сборник научных трудов общим объемом 14,5 п.л.; 32 материала учебно-методического комплекса – текстов лекций (4), методических материалов к текстам лекций (3), учебных программ (15), программ выпускной и учебной практики (4), дневников практики (4), сводных планов (1), общим объемом 93,1 п.л.; 251 статей (112) и тезиса (132) – общим объемом 60,3 п.л.
Общий объем научных трудов, опубликованных профессорско-преподавательским составом филиала в отчетном 2010/2011 уч.г. составил в общем по филиалу 343,1 п.л. и 1818,2 Мб (электронные учебники).

• Филиал осуществляет консалтинговые услуги по направлению «Народонаселение и экономика труда». По распоряжению Кабинета Министров Республики Узбекистан ученые-преподаватели Филиала во главе с директором Филиала проф. Абдурахмановым К.Х. ежегодно задействованы в научно-методической организации и проведении зональных семинаров для руководителей местных органов власти, что свидетельствует о растущем авторитете ученых Филиала в правительственной сфере.
  В Филиале также ведется научно-консалтинговая деятельность. В этом направлении осуществляется рецензирование диссертационных работ соискателей и аспирантов на соискание степени кандидата и доктора экономических наук. Рецензируемые работы обсуждаются на Теоретико-методологическом семинаре. Так, за последние три года было обсуждено 15 кандидатских и 3 докторские диссертации, в 2010-2011 уч.г. было обсуждено 5 кандидатских и докторских диссертаций.

Ежегодно в стенах Филиала проводятся выездные заседания научно-практической конференции «Международные Плехановские чтения», участие в которых принимают представители органов государственного управления Узбекистана, руководители министерств и ведомств, ректора вузов, представители дипломатического корпуса Российской Федерации и зарубежных стран, видные отечественные и зарубежные ученые, научные сотрудники, профессорско-преподавательский состав вузов, аспиранты, руководители предпринимательских структур, представители частного бизнеса.
Каждый год в Филиале проводятся круглые столы, посвященные целям развития страны на год. В ВУЗе был проведен круглый стол, посвященный итогам 2010 года на тему «Гармонично развитое поколение – основа прогресса Узбекистана», в декабре 2011 г. планируется провести круглый стол, посвященный итогам 2011 г. – Года малого бизнеса и частного предпринимательства. В сборники материалов ежегодного круглого стола, входят не только научные статьи преподавателей и специалистов, но и статьи аспирантов и соискателей, а также студентов-победителей конкурса лучших научных студенческих работ.

• Научно-исследовательской работе студентов в Филиале постоянно уделяется особое внимание как важному фактору углубления профессиональной подготовки молодых специалистов. Студенты, проявляющие интерес к научной деятельности, участвуют в исследованиях, проводимых кафедрами. Студенческие исследовательские работы по наиболее актуальным проблемам  проходили конкурсный отбор и лучшие были рекомендованы к публикации в сборниках Ежегодной студенческой научно-практической конференции. В данный сборник в 2010/011 уч.г. вошло 192 тезиса (53,7 п.л.) студентов бакалавриата и магистратуры, подготовленных под научным руководством преподавателей Филиала, руководителей научных студенческих кружков. В рамках конкурса лучших научных студенческих статей в сборнике научных трудов по круглому столу, посвященному итогам развития страны в 2010/2011 уч.г. было опубликовано 13 студенческих работ (3,9 п.л.).

В Филиале, с целью развития научно-исследовательских способностей студентов, активно функционируют и ведут научную деятельность 6 научных студенческих кружков: «Гуманитарий», «Экономист», «Финансист», «Лингвист», «Менеджер» и «Информатик-математик». В рамках работы кружков проводятся круглые столы, дебаты и мини-конференции по актуальным темам.
В рамках деятельности научных студенческих кружков в 2010/2011 уч.г. было проведено 3 круглых стола, 1 выездное заседание в музей, 2 мини-конференции, 2 научно-практических семинара, 1 викторина, 3 дебатов, 1 вечер поэзии, 3 ролевые и 4 деловые игры, 11 тематических бесед-дискуссий и 1 внутренняя олимпиада, 1 встреча и 1 праздничное мероприятие. В деятельности научных студенческих кружков большая работа была проведена по подготовке студентов к участию и выступлению на студенческих конференциях, форумах и семинарах.

Студенты бакалавриата и магистратуры Филиала в 2010-2011 уч.г. приняли участие в 6 организованных Филиалом и 9 организованных другими вузами, научными организациями и ведомствами республики и зарубежных стран конференциях, конкурсах, олимпиадах и выставках.

Для издания учебно-методической и научной литературы, подготовки материалов для проведения занятий в Филиале работает  типография, оснащенная необходимым оборудованием.  В 2010/2011 уч. г. под руководством научно-издательского отдела типографией были изданы учебные программы, краткие курсы лекций, методические рекомендации, учебные пособия, монографии, дневники и программы по учебной и преддипломной практике, бланки документов по учебно-методической работе и другой печатной продукции в объеме более 202 п.л.

• С целью развития информационной среды для научного сообщества, позволяющей представить результаты исследований рассредоточенных в пространстве научных экономических школ  в 2011 г. создан электронный научный журнал «НАУКА И ИННОВАЦИИ».  В нем размещаются научно-исследовательские работы, выполняемые учеными Филиала. Журнал содержит публикации в виде статей, коротких сообщений, обзоров по различным областям экономической сферы жизнедеятельности общества.  Необходимость такого издания назрела давно и обусловлена интенсивностью научной жизни, осуществляемой в Филиале.
  В 2010/2011 уч.г. на страницах электронного научного журнала «Наука и инновации» было размещено порядка 10 статей профессорско-преподавательского состава Филиала и РЭУ в г. Москва.